La recuperación de cadáveres llevó meses. Simplemente el apagar todos los fuegos que ardían entre los escombros se demoró semanas, mientras que el desescombro completo no terminó hasta mayo de 2002. Se instalaron miradores provisionales para observar el trabajo de los equipos, que fueron retirados el 30 de mayo de 2002.
Asimismo, se iniciaron muchas recogidas de fondos para ayudar a las víctimas de los atentados y a los familiares de los fallecidos. Una vez cumplido el plazo para pedir las indemnizaciones (11 de septiembre de 2003) 2.833 personas habían recibido el pago.

Homenajes

Se han celebrado diversas ceremonias conmemorativas en honor de las víctimas de los atentados. Una llama eterna fue encendida por el Alcalde en el primer aniversario del atentado. Se espera que en otoño de 2006 se completará un homenaje en el Pentágono, donde ya existe el America’s Heroes Memorial (Homenaje a los Héroes de Estados Unidos) desde septiembre de 2002, cuando se terminaron las obras de reparación, aunque la visita al mismo es restringida.
Esta prevista la construcción de un monumento al vuelo 93 de United Airlines llamado “Crescent of Embrace” (abrazo de medialuna), fuente de controversia por sus similitudes con símbolos islámicos, lo que hizo que se tuviera que rediseñar.
La construcción del World Trade Center Memorial empezó en marzo de 2006. El diseño del mismo, fue un Reflejo de Ausencia de Michael Arad, que se espera estará terminada en 2009.
Muchos monumentos más se han construido o se están construyendo por todo el mundo. Además, numerosos familiares de víctimas han fundado organizaciones benéficas en honor de los muertos. La fundación Wikimedia abrió también un wiki dedicado a los atentados, que fue cerrado el 15 de septiembre de 2006.